سازمان لیگ فوتبال ایران در پی اظهارات عضو هیئت رئیسه فدراسیون فوتبال علیه او شکایت کرد و اعلام کرد: «انتشار مطالبی غیرمستند و حاوی توهین به مسئولان سازمان لیگ از سوی مهرداد سراجی به منظور تشویش افکار عمومی انجام شده که مراتب از طریق مراجع قضایی و کمیته اخلاق تحت پیگیری است.»
سراجی پیش از این در توییتهایی مدعی شده بود که سازمان لیگ فاقد شفافیتهای مالی است و اسناد مشخصی ندارد.